高檔的高速離心機都采用了微電腦控制系統，這些控制系統不但能確保離心機安全的運行還能自動完成工作任務。現在很多離心機都有較好的人性化的控制系統．比如：轉子識別功能，安全鎖功能，故障提示功能，加速和減速曲線等等。除以上幾點之外還要注意一些細節和必要的配件。離心機的主要部件是電機，電機分為帶碳刷電機和無碳刷電機，前者已經淘汰，現在的離心機大多都是無碳刷電機，有的電機還帶有剎車功能。
　　目前，高速離心機的轉速已可達到28000~30000r/min。大部分離心機不帶真空系統，操作類似于低于離心機，非常簡便，而其功能足夠強大，可替代一部分超速離心機，而超速離心機的操作復雜，維護既麻煩又昂貴。除處理量較小的微量離心機以外，高速離心機都配置冷凍系統，以抵消轉子在高速旋轉中產生的熱量，確保生物樣品在離心操作中不變性。高速冷凍離心機的使用溫度一般在4~6℃，波動要求控制在±2℃。有的離心機帶真空系統，它不同于超速離心機的高真空，是部分真空，真空度不高。其目的是減少轉子在空氣中摩擦生熱，減少轉子旋轉噪聲，也有利于減輕電機負荷，延長驅動系統的壽命。
　　高速離心機的主要指標是最高轉速和最大轉子容量。由于機械強度的原因，體積小的轉子最高轉速高，而大容量轉子的最高轉速則低。高速冷凍離心機最大容量轉子一般為6×500ml，其最高轉速一般為10000r/min，近年出現6×1000ml、約8000r/min，但其價格較貴。那些具有相對離心加速度100000g的高速離心機（尤其離心機提供垂直轉子的話）可代替超速離心機的部分使用范圍。當然離心時間相對超速離心機長一些。
　　高速離心機運轉時使用制冷,由于空氣的水分,在離心腔內結霜,停機后霜化為水。大部分國外的低速大容量離心機,沒有排水孔,離心腔中水愈積愈多。此時,用戶應自行拆下轉子,清理積水。在重新安裝轉子時,一定要裝好,避免出事故。離心機在設計與制造時,對轉子的加工誤差帶來的不平衡,已作了動平衡試驗的補救,但凡是高速離心機,都有其允許的裝樣不平衡量。離心機裝樣如果不平衡量較大的話，超出允許量,離心機雖然也可以運轉,但這時產生的不平衡力以每分鐘n次頻率猛然沖擊軸承及支架,離心機是受損傷的。因此,用戶對那些昂貴的離心機,盡量找好平衡后離心,對離心機的壽命有好處。
　　高速離心機完成離心時，要等離心陀完全靜止后，才能打開艙門；請盡快取出離心管，先觀察離心管是否完全，以及沉淀的位置，快速把上清液倒出，小心不要把沉淀弄混濁。不管所要的是上清或沉淀，請取用干凈的燒杯收集上清，以免有失誤。傾倒上清要很小心，以免把沉淀一起倒出來；若不慎混在一起，就要重來一次。若高速離心機離心管有漏，要找出原因，并且立刻清理離心陀或離心艙。